- La nascita dell'editoria musicale romana: Andrea Antico e il "Liber Quindecim Missarum", in «Annuario del Conservatorio di Musica di S. Cecilia», Roma, Conservatorio di S. Cecilia, 1974, pp. 161-173.

- Fortuna del Tenor «L'homme armé» nel primo Rinascimento, in «Nuova Rivista Musicale Italiana», IX (1975) 2, pp. 3-36.

- Note sull'impiego del cantus firmus nelle Messe di Palestrina, in Atti del Convegno di Studi Palestriniani (28 settembre - 2 ottobre 1975), Firenze, Olschki, 1977, pp. 329-338.

- I mottetti di Lulli e la codificazione del gusto francese nella seconda metà del secolo XVII, in Heinrich Schütz e il suo tempo. in Atti del I Convegno Internazionale di Studi (Urbino, 29-31 luglio 1978), Roma, Società Italiana del Flauto Dolce, 1980, pp. 343-396.

- Musicisti italiani e musica sacra a Versailles negli anni del Re Sole, in «Rivista internazionale di Musica Sacra», III (1982) 1, pp. 7-26.

- Claudio Monteverdi, Il Quinto Libro dei madrigali a cinque voci, edizione critica a cura di Maria Caraci, Cremona, Fondazione Claudio Monteverdi, 1984.

- Le cantate romane di Alessandro Scarlatti nel Fondo Noseda, in Händel e gli Scarlatti a Roma. Atti del Convegno Internazionale di Studi (Roma, 12-14 giugno 1985), Firenze, Olschki, 1987, pp. 93-111.

- La produzione di Vincenzo Fiodo nel Fondo Noseda della Biblioteca del Conservatorio di Milano, in Musicisti nati in Puglia ed emigrazione musicale tra Seicento e Settecento. Atti del Convegno Internazionale di Studi (Lecce, 6-8 dicembre 1985), Roma, Torre d'Orfeo, 1988, pp. 227-239.

- Niccolò Zingarelli tra mito e critica, in «Nuova Rivista Musicale Italiana», XXII (1988) 3, pp. 375-422.

- Il «Dialogo de Musica» di Antonio Fileremo Fregoso, in «In cantu et in sermone», for Nino Pirrotta on his 80th Birthday, Firenze, Olschki - University of W. Australia Press, 1989, pp. 101-119.

- Osservazioni intorno al Settimo Libro dei madrigali a cinque voci di Luca Marenzio, in Luca Marenzio musicista europeo. Miscellanea di studi in memoria di Federico Mompellio, Brescia, Fondazione Civiltà Bresciana, 1990, pp. 9-48.

- Osservazioni sulla persistenza di rapporti musicali con l'Italia nel Portogallo del Primo Seicento, in A Expansão Europea: O Dialogo Luso-Italiano (Coimbra, 14-18 ottobre 1990), in «Mare Liberum», 2 (1991), pp. 131-144.

- Il lamento polifonico e il lamento monodico da camera all'inizio del Seicento: rapporti stilistici e reciprocità di influssi, in Seicento inesplorato. L'evento musicale tra prassi e stile: un modello di interdipendenza, Como, AMIS, 1993, pp. 339-83.

- Il «tragico colorito» della musa zingarelliana dalle cantate da camera alle romanze da salotto, in «Gli affetti convenienti all'idee», a cura di Maria Caraci Vela, Rosa Cafiero e Angela Romagnoli, Napoli, Edizioni Scientifiche Italiane, 1993, pp. 423-52.

- Un capitolo di arte allusiva nella prima tradizione di messe «l'homme armé», in «Studi musicali», a. XXII n. 1 (1993), pp. 3-21.

- La critica del testo musicale, a cura di Maria Caraci Vela, Lucca, LIM, 1995.

- Le specificità dei testi musicali e la filologia: alcuni problemi di metodo, in «Filologia mediolatina», II (1995), pp. 43-56.

- Problemi di diffrazione nel repertorio polifonico del Quattrocento, in L'edizione critica tra testo musicale e testo letterario, Lucca, LIM, 1995, pp. 373-78.

- Lo sfoggio di mousikè epistéme una singolare cinquecentina milanese: la Calipsychia di Tomaso Radini Tedeschi (1511), in Varietà d'harmonia et d'affetto. Studi in onore di Giovanni Marzi per il suo LXX compleanno, Lucca, LIM, 1996, pp. 91-107.

- Una nuova attribuzione a Zacara da un trattato musicale del primo Quattrocento, in"Acta Musicologica" XIX(1997) 2, pp182-185.

- Il «Trattato sulla musica» della Biblioteca Agnesiana di Vercelli, (con commento musicologico a cura di M. Caraci Vela e analisi linguistica a cura di Anna Cornagliotti) Firenze, Fondaz. Franceschini-Cremona, SPFM e Fondaz. Stauffer, 1998.

- Madrigali-nel-tempo: diasistemi monteverdiani, negli Atti del Convegno Claudio Monteverdi. Studi e Prospettive, (Mantova, Accademia Virgiliana, 21-24 ottobre 1993), Firenze, Olschki, 1998, pp. 133-145.

- La tradizione landiniana: aspetti peculiari e problemi di metodo, in Col dolce suon che da te piove. Studi su Francesco Landini e la musica del suo tempo in memoria di Nino Pirrotta, ("Studi e Testi" SPFM 2) Firenze, SISMEL - ed. del Galluzzo, 1999, pp. 15-35.

- Intertestualità allusiva e tecniche ipertestuali nelle messe l'homme armé del secolo XV, in Album Amicorum Albert Dunning. In occasione del suo LXV compleanno, Turnhout, Brepols, 2002, pp.21-69.

- De Compère à Gaffurio: la musique à Milan à l'époque de la conquète française, in Louis XII en milanais. XLI Colloque international d'études humanistes, 30 juin – 3 juillet 1998, a cura di Philippe Contamine e Jean Guillaume, Paris, Champion, 2003, pp. 365-390.

- Maria Caraci Vela e Roberto Tagliani, Deducto sei: alcune osservazioni e una nuova proposta di edizione, in"…Et faciam dolçi canti". Studi in onore di Agostino Ziino in occasione del suo 65 compleanno, a cura di Bianca Maria Antolini, Teresa Maria Gialdroni e Annunziato Pugliese, Lucca, LIM, 2004, pp. 263-294 (M. Caraci Vela pp.263-280).

- Maria Caraci Vela, Dall'arte allusiva all'intertestualità fisiologica: aspetti del processo compositivo in Zacara da Teramo, negli Atti del Convegno internazionale di studi su Zacara da Teramo e il suo tempo, (Teramo, 4-8 dicembre 2002), Lucca, LIM, 2005, pp. 187 – 211.

- Maria Caraci Vela, La filologia musicale. Istituzioni, storia, strumenti critici, vol. 1 (I fondamenti storici e metodologici della Filologia musicale), Lucca. LIM, 2005.

- Maria Caraci Vela, Introduzione a La notazione della polifonia vocale sec. IX-XV, vol. I, Antologia, a cura di Maria Caraci Vela, Daniele Sabaino e Stefano Aresi, ETS, Pisa, 2007, pp. IX-XV.

-"Vous avez bu l'amour et la mort". Il mito di Tristano e Isotta nella rilettura di Bédier e Martin. In "Philomusica on line" n. 6 (2007-2008).

- Maria Caraci Vela, La filologia musicale. Istituzioni, storia, strumenti critici, vol. 2 (Approfondimenti), Lucca. LIM, 2009.

- La dama di palazzo e il 'nobile ornamento. L’esercizio della musica come spazio di libertà e di cultura, in Costumi educativi nelle corti europee (secoli XIV-XVIII), a cura di Monica Ferrari, Pavia, Pavia University Press, 2010, pp. 31-42.

- Studies on Trecento Italian Music in the 21st Century: Some Observations on present Directions of Research./ Gli studi sulla musica italiana del Trecento nel secolo XXI: qualche osservazione sui recenti orientamenti della ricerca, in “Philomusica on line” 10 (2011), pp. 61-95.

Recensioni lunghe:

ne "Il Saggiatore Musicale" VI (1999) 1-2, pp. 265-272.1 (2001):
- James Grier, The Critical Editing of Music. History, Method, and Practice, Cambridge, Cambridge University Press, 1996, ne "Il Saggiatore Musicale" VI (1999) 1-2, pp. 265-272.1 (2001);

in Philomusica on line 2001 (http://philomusica.unipv.it/):
- Johannes Ockeghem. Actes du XL Colloque international d'Études humanistes, edités par Philippe Vendrix, Paris, Klinksieck, 1998;
- Antoine Busnois, Method, Meaning and Context in Late Medieval Music, ed. Paula Higgins, Oxford, Clarendon Press, 1999.

In corso di stampa:
- [con Pietro Zappalà] Die musikwissenschaftliche Fakultät der Universität von Pavia in Cremona: Geschichte, Aufgaben und Methodik, relazione al convegno "Musik und kulturelle Identität", XIII. Internationaler Kongress der Gesellschaft für Musikforschung, Weimar, 16. Sept. 2004.

In preparazione:
- Maria Caraci Vela, La filologia musicale. Istituzioni, storia, strumenti critici, vol. 3, Lucca. LIM.